Variantes que desaparecen: lecciones de Gamma, Iota y Mu

A principios de 2021, científicos en Colombia descubrieron una variante preocupante del nuevo coronavirus. La variante, eventualmente conocida como mu, tiene varias mutaciones inquietantes que los expertos creen que podrían ayudarlo a evadir las defensas del sistema inmunológico.

En los meses siguientes, el mu se propagó rápidamente en Colombia, lo que provocó un aumento en los nuevos casos de COVID-19. A fines de agosto, se había encontrado en docenas de países y la Organización Mundial de la Salud lo había designado como una «variante de interés».

«Mu está empezando a hacer algo de ruido a nivel mundial», dijo Joseph Fauver, epidemiólogo genómico del Centro Médico de la Universidad de Nebraska y autor de un estudio reciente sobre la variante.

Entonces falla. Hoy, esta variante casi ha desaparecido.

Hay una gamma, un iota o un mu para cada delta u omicrón, y estas variantes generan aumentos repentinos locales pero nunca recorren el globo. Si bien comprender omicron sigue siendo una importante prioridad de salud pública, hay lecciones que aprender de estos linajes más pequeños, dicen los expertos.

“El virus no ha dejado de adaptarse y evolucionar”, dijo Joel Wertheim, epidemiólogo molecular de la Universidad de California en San Diego. «Observar cómo se hizo en el pasado nos ayudará a prepararnos para lo que podría hacer en el futuro».

El estudio de los perdedores arroja luz sobre las lagunas de vigilancia y los errores de política, proporcionando más evidencia de que la prohibición de viajes internacionales de EE. UU. fue ineficaz, y por qué el virus tuvo éxito, lo que sugiere que en las primeras etapas de una pandemia, la transmisibilidad era más importante que el escape de la inmunidad. .

El estudio también destaca la importancia del contexto. Las variantes que tienen un impacto en algunos lugares nunca se afianzarán en otros. Como resultado, es difícil predecir qué variantes dominarán, y se requerirá una vigilancia integral casi en tiempo real para detectar futuras variantes y patógenos.

«Podemos hacer esto observando la secuencia del genoma viral y diciendo: ‘Esto es probablemente peor que el otro'», dijo Wertheim. «Pero la única forma de saberlo realmente es ver cómo se propaga, porque hay tantas variantes potencialmente peligrosas que nunca se dieron cuenta».

aqui esta para ver mu

Los coronavirus cambian constantemente y la mayoría de las nuevas variantes nunca se notan ni se nombran. Pero otros hacen sonar la alarma, ya sea porque se están volviendo más comunes rápidamente o porque sus genomas parecen siniestros.

Ambos eran ciertos cuando mu se difundió en Colombia.

«Contiene algunas mutaciones que la gente ha estado observando de cerca», dijo Mary Petrone, epidemióloga genómica de la Universidad de Sydney y autora del nuevo artículo mu. Se han demostrado varias mutaciones en su proteína de pico en otras variantes de evasión inmune, incluidas beta y gamma.

En el nuevo estudio, que aún no ha sido publicado en una revista científica, los científicos compararon la biología de mu con las de alfa, beta, delta, gamma y el virus original. Descubrieron que Mu no se replicaba más rápido que cualquier otra variante, pero era la variante que más evadía el sistema inmunológico, más resistente a los anticuerpos que cualquier variante conocida, excepto omicron, dijo Fauver.

Al analizar las secuencias del genoma de muestras de mu recolectadas en todo el mundo, los investigadores reconstruyeron la propagación de la variante. Llegaron a la conclusión de que es probable que mu esté presente en América del Sur a mediados de 2020. Luego se extendió durante varios meses antes de ser descubierto.

La vigilancia genómica en muchas partes de América del Sur está «dividida e incompleta», dijo Jesse Bloom, experto en evolución viral en el Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson en Seattle. «Con un mejor monitoreo en esas áreas, podría ser más fácil y rápido evaluar el nivel de preocupación sobre los acres».

Mu también presentó otro desafío. Resultó que tenía una mutación, llamada mutación de cambio de marco, que es rara en las muestras de coronavirus. Cuando los científicos, incluido Fauver, intentaron cargar sus secuencias mu en GISAID, un repositorio internacional de genomas virales que se utiliza para controlar las nuevas variantes, las mutaciones se marcaron como errores.

Esta complejidad crea un retraso en el intercambio público de secuencias mu. Los investigadores encontraron que el tiempo entre la recolección de muestras de virus de un paciente y su disponibilidad pública en GISAID fue consistentemente más largo para los casos mu que para los casos delta.

«El genoma en sí mismo básicamente está creando brechas de vigilancia artificiales», dijo Fauver. «Esto ha resultado, al menos en nuestra experiencia, en que generalmente tratamos de obtener datos en días y semanas antes de hacerlo».

(Los investigadores enfatizan que el sistema de control de calidad de GISAID es importante y el repositorio ha abordado este problema).

Combinando estas vulnerabilidades de vigilancia con las capacidades de evasión inmune de mu, la variante parece estar lista para despegar. pero no es la verdad. Los científicos han encontrado, en cambio, que el mu se irradia a otros continentes desde América del Sur y Central, pero no se propaga ampliamente una vez que llega allí.

«Esto sugiere que esta variante no es necesariamente tan adecuada para las poblaciones de América del Norte y Europa como esperábamos», dijo Petron.

Esto puede deberse a que mu se encuentra compitiendo con una variante más poderosa: delta. Delta no es tan bueno como mu para esquivar anticuerpos, pero se propaga más fácilmente. «Entonces, al final, el delta se extendió más ampliamente», dijo Bloom.

Variante correcta, momento correcto

La investigación de variantes exitosas solo cuenta la mitad de la historia.

«En cierto modo, la variante no dominante es el control negativo», dijo Petrone. «Nos están diciendo lo que no va a funcionar, y hacerlo ayuda a llenar los vacíos de conocimiento sobre la aptitud de las variantes».

Delta superó varias variantes de evasión inmune además de mu, incluidas beta, gamma y lambda. Este patrón sugiere que la evasión inmune por sí sola no es suficiente para permitir que las variantes superen a las versiones altamente transmisibles del virus, o al menos no en las primeras etapas de la pandemia, cuando pocas personas eran inmunes.

Pero la vacunación y las múltiples oleadas de infección han cambiado el panorama inmunitario. Una variante altamente inmune-evasiva ahora debería tener más ventajas, dicen los científicos, lo que puede ser parte de la razón por la cual omicron ha tenido tanto éxito.

Otro estudio reciente mostró que en la ciudad de Nueva York, la gamma de evitación inmunológica tiende a funcionar mejor en vecindarios con niveles más altos de inmunidad preexistente, en algunos casos porque fueron afectados por la primera ola de COVID-19.

«No podemos ver una nueva variante en el vacío porque aparece a la sombra de todas las variantes anteriores», dijo Wertheim, autor del estudio.

De hecho, los conflictos de variantes anteriores han demostrado que el éxito depende en gran medida del contexto. Por ejemplo, la ciudad de Nueva York puede albergar la variante iota, que se identificó por primera vez en muestras de virus recolectadas en noviembre de 2020. «Así que se afianzó muy pronto», dijo Petrone. Incluso después de que surgiera la variante alfa más propagable, el iota siguió siendo la variante principal de la ciudad durante meses antes de desaparecer.

Pero en Connecticut, donde tanto iota como alfa aparecen en enero de 2021, las cosas son diferentes.

«Alpha despegó de inmediato, mientras que iota no tuvo ninguna posibilidad», dijo Petrone, quien dirigió el estudio de variantes en ambas regiones.

Patrones similares han comenzado a desarrollarse en múltiples linajes de omicron. En los Estados Unidos, la subvariante BA.2.12.1, descubierta por primera vez en Nueva York, ha despegado, mientras que en Sudáfrica, BA.4 y BA.5 están impulsando nuevas oleadas.

Esa es otra razón para estudiar variantes debilitadas, dice la bióloga evolutiva Sarah Otto de la Universidad de Columbia Británica. Una variante que no encaja bien en un momento y lugar puede despegar en otro. De hecho, la desgracia de Mu puede ser que llegó demasiado pronto.

«Probablemente no hay suficientes personas que tengan inmunidad para impulsar realmente esta variante», dijo Otto.

Pero la siguiente variante preocupante podría ser descendientes de linajes inmuno-evasivos, o algo así, que nunca se afianzó del todo, dijo.

La revisión de variantes anteriores también puede proporcionar información sobre lo que funcionó o no las incluyó. El nuevo estudio de Gamma proporciona más evidencia de que es poco probable que las prohibiciones de viajes internacionales, al menos cuando las imponen los EE. UU., impidan la propagación mundial de la variante.

Gamma se detectó por primera vez en Brasil a finales de 2020. En mayo de ese año, EE. UU. prohibió a la mayoría de los ciudadanos no estadounidenses ingresar al país desde Brasil, una restricción que continuará hasta noviembre de 2021. Sin embargo, el estado Gamma de enero de 2021 se descubrió en los EE. UU. y pronto se extendió a docenas de estados.

Debido a que gamma nunca ha sido globalmente dominante, estudiar su propagación proporciona una «imagen más clara» de la efectividad de la prohibición de viajar, dice Tetyana Vasylyeva, epidemióloga molecular de la Universidad de California en San Diego y autora del estudio.

«Cuando se trata de estudiar variantes, digamos, delta, el tipo de cosas que causan explosiones masivas en todas partes, a veces es muy difícil encontrar patrones porque está sucediendo a gran escala y muy rápido», dice.

En medio de la emergencia de salud mundial en curso, con el virus que cambia rápidamente, existe una necesidad comprensible de centrarse en el futuro, dijo Fauver. A medida que la atención del mundo se centró en delta y omicron, él y sus colegas discutieron si continuar trabajando en noticias antiguas mu.

«Pensamos: ‘¿A alguien le importa mu?'», recuerda Fauver. «Pero creemos que todavía hay espacio para investigaciones de alta calidad que pregunten sobre variantes previamente enfocadas y traten de mirar hacia atrás en lo que sucedió».